醫藥門店管理軟件是一款具有零售前臺POS管理、購進業務管理、批發業務管理、物流配送管理、庫存管理、物價管理、財務帳目管理（商品會計管理）、業務數據查詢管理、小帳簿管理、分析決策管理、資料檔案管理、藥品質量管理（GSP）、連鎖總店管理、連鎖分店管理、總店分店數據通訊管理、錯誤票據管理、系統稽查日志管理等功能摸塊的軟件。
醫藥門店管理軟件的功能和特點：
1、軟件從功能上主要分為零售前臺POS管理、購進業務管理、批發業務管理、物流配送管理、庫存管理、物價管理、財務帳目管理（商品會計管理）、業務數據查詢管理、小帳簿管理、分析決策管理、資料檔案管理、藥品質量管理（GSP）、連鎖總店管理、連鎖分店管理、總店分店數據通訊管理、錯誤票據管理、系統稽查日志管理等功能摸塊。
另外還有強大的二次開工具（自定義單據、自定義查詢、自定義打印（套打）、自定義定義業務流程）；軟件從業務模式上主要適合醫藥批發、零售、批發兼零售和連鎖超市及配送等，從系統操作平臺主要分單機版和網絡版、廣域網版等功能組成。
2、商品質量管理(GSP管理)：系統緊隨國家藥品質量管理政策，系統提供詳細的管理報表如首次經營藥品審批表、采購藥品通知單、驗收報表、藥品養護檔案表、不合格藥品表、報廢藥品銷毀表、退貨通知單、及藥品質量相關臺帳。如：藥品驗收紀錄、銷售紀錄、出庫復核記錄、退貨臺帳等。
3、決策報表：
零售提供：零售商品匯總表、收銀員匯總報表、營業員匯總報表、零售流水表等管理報表；
庫存提供：進、銷、存帳表、庫存總帳及明細帳、廠商（產地）庫存余額、效期報警、庫存積壓分析、銷售未出、進貨未入商品匯總及明細表；
銷售提供：商品銷售匯總及明細分析表、客戶銷售匯總及明細分析表、業務員銷售匯總及明細分析表、商品銷售成本匯總及明細分析表；
進貨提供：商品進貨匯總及明細分析表、客戶進貨匯總明細分析表、業務員進貨匯總明細分析表；
往來帳提供：應收應付、預收預付款匯總及明細帳及應收應付帳齡分析。