醫藥是涉及人民生命安全的重要物資，醫藥行業可以細分為制藥行業與醫藥流通行業。制藥行業以大容量注射劑、片劑、膠囊劑、原料藥為主，醫藥流通行業則涵蓋西藥、中藥、醫療器械等產品，兩種形態的企業物流運營管理體系不一樣，制藥企業注重的是從生產、搬運、入庫、保管、到出庫的全流程作業模式管理；醫藥流通企業則以降低庫存、快速周轉為目標，偏重于多樣性的揀選作業模式與高效率的分揀模式。
新版《藥品經營質量管理規范》（GSP）等法律法規的出臺，對醫藥物流倉儲提出了更嚴謹的要求，醫藥企業需把物流倉儲提升到企業戰略經營的角度進行思考與管理，管好物流倉儲，需要做到以下要求：重視批號管理，指定批號出庫；重視藥品流向跟蹤；重視藥品的電子監管、器械全程跟蹤管理；重視藥檢單管理；重視存儲條件劃分；重視與物流設備的聯動。以企業為追溯體系建設主體責任的后藥監時代已經到來。
基于醫藥企業的特性，醫藥倉庫管理wms系統有著特定的要求：
1、全程藥品批號管理：醫藥倉庫管理wms系統需針對每一批次藥品進行特性化、精細化管理，以藥品批次為管理對象進行各項作業，支持先進先出、指定批號出庫、不可混批出庫、多批號出庫等，確保藥品批號的嚴格控制與追溯。
2、藥品質量管理貫穿作業環節：不僅需要獨立完善的質量管理功能模塊，在各作業環節倉儲系統也應處處體現質量管控的要求，如抽樣送檢、逐筆驗收、有效期管理等，確保對藥品質量的嚴格管控貫穿于各個作業環節始終。
3、醫藥認證支持：醫藥倉庫管理wms系統的各個環節，應當依從并且遵循國際國內的各類管理規范，滿足企業對醫藥GMP、GSP、 FDA、EMEA 等認證的要求。
4、藥品電子監管碼接口：藥品電子監管碼是國家實施電子監管所賦予每件藥品的標識，醫藥倉庫管理wms系統必須實現與電子監管碼系統實時接口平臺，在生產、流通的各環節實現藥監碼的獲取、藥監碼信息查詢與藥監碼信息上傳，滿足雙向追溯的要求。
對于醫藥企業來說，建立追溯體系，提升倉儲管理信息化，對供應鏈上下游加強管控，是響應國家政策及市場需求的信息服務生態鏈重要的途徑。